线性离子阱质谱仪是赛默飞世尔科技旗下较具代表性的质谱技术平台之一。它通过采用四个并联排列的棒状电极，利用射频电压在径向和轴向限制离子，从而在细长的中央通道内实现对离子的捕获与分析。
这种独特的结构赋予了线性离子阱较高的离子储存容量和良好的灵敏度，使其在进行复杂分子结构解析时表现出色。线性离子阱质谱仪核心优势主要体现在以下几个方面：
一、良好的多级质谱（MSⁿ）能力
线性离子阱能够轻松实现多达10级的碎片离子扫描（MSⁿ）。在分析过程中，选定的母离子可以被连续碎裂成子离子，并进一步在后续步骤中碎裂。每一次额外的碎裂步骤都能使化合物的鉴定更加确定，为未知化合物的结构表征提供极其丰富的信息。
二、丰富的碎裂技术
为了应对不同化合物的分析需求，线性离子阱配备了多种互补的碎裂模式：
1.CID（碰撞诱导解离）：经典的碎裂方式，适用于常规结构解析。
2.PQD（脉冲Q解离）：能够生成更多的碎片离子，并有效扩展低质量端的碎片信息。
3.ETD（电子转移解离）：特别适用于蛋白质组学研究，能够在生成大量肽段碎片的同时，保护不稳定的翻译后修饰（PTM）基团（如磷酸化），极大提高蛋白序列覆盖率。
4.Trap-HCD（阱-高能碰撞解离）：在Velos Pro等型号中引入，提供类似三重四极杆的碎裂效果，有助于结构解析和同位素标记肽段的定量。
三、代表性仪器型号
1.LTQ XL：作为一款经济且灵活的高性能线性离子阱质谱仪，LTQ XL 提供了出色的全扫描灵敏度和MSⁿ 谱图质量，广泛应用于代谢物鉴定、蛋白质组学及生物标志物研究。
2.Velos Pro（双压线性离子阱）：作为更先进的型号，Velos Pro 引入了双压离子阱设计，显著提升了扫描速度（高达 66,000 Da/sec）和质量数分辨率。结合全新的检测电子学和Trap-HCD技术，它在保持较高定性能力的同时，大幅增强了定量性能（提供6个数量级的线性动态范围）。
四、混合高分辨系统
为了突破传统离子阱在质量精度和分辨率上的限制，赛默飞将线性离子阱与超高分辨率的质量分析器结合，推出了较强的混合质谱平台。例如，将双压线性离子阱与静电场轨道阱（Orbitrap）结合的 LTQ Orbitrap Velos Pro，既保留了离子阱高通量、多级质谱的定性优势，又获得了超高分辨率和亚 ppm 级的精确质量测定能力，是天然产物分析、代谢组学和蛋白质组学等领域的利器。
