超声波细胞破碎仪是一种利用强超声在液体中产生空化效应，对物质进行超声处理的多功能、多用途的仪器，能用于多种动植物细胞、病毒细胞的破碎，同时可用来乳化、分离、匀化、提取、消泡、清洗及加速化学反应等等。被广泛应用于生物化学、微生物学、药物化学、表面化学、物理学、动物学等领域。
整套机器设备安装到位后，检查各系统联接无误（进水管/出水管、排水管、冲洗水管、电源、电路），观察物料样品是否通过透明胶管进入主机进口，冷却循环水是否正常运转流通，然后操作相关按钮，使主机正常工作。超声波细胞破碎仪的具体步骤见下： 
（1）接通总电源，整机通电。将钥匙插入工作/锁定转换孔，并旋到工作位置。 
（2）进样杯中加满纯净水或缓冲液，按“液压泵”“开”按钮（绿色），油泵启动，供油压力输入主附油缸。 
（3）按“主机”“开”按钮，机器正常运转（往复运动）。 
（4）顺时针缓慢调节调压阀，使低压表、高压表压力同步上升，根据样品种类，调节破碎压力（200Mpa以下）。 
（5）当纯净水或缓冲液到达进样杯颈部时，按“主机”“关”按钮，机器停止运转。将待破碎样品加入进样杯中，按“主机”“开”按钮，细胞破碎开始。经均质阀破碎后的样品，沿循环冷却管路冷却后，从出样口流出，样品一次破碎完成（可根据需要，进行多次破碎）。
（6）样品破碎完后，逆时针调节调压阀，使右边低压表至“0”位，加入纯净水或75%酒精进行清洗，直至出样清澈。
（7）按左边红色“主机”“关”按钮，再按右边红色“液压泵”“关”按钮；逆时针打开卸压阀，使高压表回“0“位。卸压完毕后，立即顺时针关上卸压阀。
（8）关掉总电源，拔掉电源线。