多肽合成仪在操作过程中可能因仪器性能、操作规范、试剂质量或环境因素等引入误差，影响合成效率和目标多肽的纯度。以下是常见的误差类型及其原因分析：
一、化学合成相关的误差
1. 氨基酸活化不完*或副反应
问题：
氨基保护基团去保护不完*，导致偶联效率低。
活化剂用量不足或反应时间不够，造成氨基酸未能完*活化。
消旋化（如使用强碱性条件时，L-氨基酸部分转化为D-构型）。
后果：
目标肽链长度不足（缺失部分氨基酸），或产生非对映异构体杂质。
2. 偶联效率低
问题：
氨基酸当量比例不当（如过量溶剂或单体不足）。
反应体系pH控制不准确（如EDC偶联需弱酸性条件）。
溶剂选择不当（如DMF含水量过高导致氨基水解）。
后果：
肽键形成不完*，产生断裂的短肽片段或未反应的游离氨基。
3. 侧链保护基脱落或残留
问题：
保护基在酸性或碱性条件下不稳定，提前脱落。
脱保护步骤（如TFA处理）不彻*，导致侧链保护基残留。
后果：
目标多肽的侧链功能基团异常。
二、多肽合成仪仪器操作相关的误差
1. 温度控制不准确
问题：
加热或冷却模块温控精度不足，影响反应速率或导致副反应。
温度传感器校准错误（如实际温度与显示值不符）。
后果：
缩合反应效率低，或高温导致氨基酸分解。
2. 流速或压力波动
问题：
输液泵流量不稳定，导致反应体系浓度变化（如氨基酸进料不均匀）。
压力传感器故障，造成洗涤或溶剂切换不完*。
后果：
局部反应物浓度过高或过低，产生断链或副产物。
