大小鼠微透析探针是微透析技术的核心，选择合适的探针是是微透析实验的关键。探针的选择由植入的区域、透析物质和回收率等因素决定。根据实验部位以及目标分子的理化性质选择合适的探针实现活体取样。有多种类型，同心圆探针、线性探针和U型探针等。其中，同心圆探针和线性探针为常用探针类型。
同心圆探针根据探针用途可分为脑部探针和血液探针。脑部探针如CMA探针有CMA 7、CMA 11和CMA 12。其中CMA 7用于小鼠离散大脑区的一种细硬质探针，CMA 11则是用于大鼠离散大脑区的一种细硬质探针，而CMA 12是用于中枢神经系统研究的最佳探针，可长期植入。CMA的血液探针型号为CMA 20，CMA 20 是一种软性的金属探针，主要用于清醒自由活动动物或麻醉动物的肌肉、心脏、皮肤和脂肪等。
大小鼠微透析探针线性探针是线性管路的结构，管路中间为透析膜，一般用于外周组织，如皮肤、肌肉、心脏、肝脏、眼睛和胰腺等位置，也可以同于肿瘤的植入。可根据实验需要有相对应截留量的探针进行选择。
微透析系统管路体积都很小，在使用过程中需注意操作规范。
1、使用前管路系统检查
探针接上tubing管前, 先用syringe确认tubing管是通的, 无阻塞(若tubing管有阻塞, 会将探针membrane胀破), 再将探针与tubing管一段一段慢慢接上, 确定管路中无气泡。
2、新探针使用
干式探针：探针放入蒸馏水, 注射器充满蒸馏水, 流速 2 微升/min, 灌流20 min以上。
3、实验后探针清洗:
（1）探针先泡肝素液(液态肝素液可跟蒸馏水对半稀释, 粉末状肝素可跟蒸馏水配（1mg/ml)20 min。
（2）探针换泡蒸馏水, 注射器放蒸馏水, 流速 2 微升/min, 灌流过夜。
4、使用后保存
可放在蒸馏水中保存探针; 若长时间不使用可晾干保存。
