水平离心机的离心技术在生物科学特别是生物化学和分子生物学研究领域，已得到十分广泛的应用，每个生物化学和分子生物学实验室都要准备多种型式的离心机。离心技术主要用于各种生物样品的分离和制备，生物样品悬浮液盛放在离心管中在高速旋转下，由于巨大的离心力作用，使悬浮的微小颗粒（如细胞器、生物大分子的沉淀等）以一定的速度沉降，从而与溶液得以分离。
水平离心机的水平转子离心管放置在吊篮里，吊篮是轴对称地挂在转子上。旋转时，吊篮受离心力而由垂直位置甩到水平位置，故也称为外摆动式转子和摆平吊篮转子等。
当水平转子在离心机中旋转时，离心力的作用方向是径向的，在水平切面是对称的扇形，只有离心管中心线上的颗粒与离心力场方向一致，其他位置的颗粒在沉降过程中会碰到管壁，沿管壁沉降。在转子中的管壁效应没有在角转子中严重。离心管中的颗粒沉降路径与旋转轴垂直，初样品区带中心的颗粒将径向沉降，然而靠近管壁处的颗粒会先与管壁碰撞，离管壁的距离不同，则到达管底的先后不同，使区带加宽，也会引起颗粒堆积成块、对流干扰和其他异常现象。
对水平离心机的使用来说，平衡转子是获得好的分离效果的关键。对于不同吊篮（试管）数的平衡，轴对应试管的重量平衡称重误差必须保持在0.1g以内，而吊篮必须轴对称地安放砸转子体上，有些离心机要求全部吊篮都必须对号安装。
首先制备梯度，铺放样品，把吊篮挂(安装）在转子上；转子加速时，吊篮开始摆起，转速达800r/min以上时，吊篮与转子旋转轴成90°的水平位置，不发生梯度重定向；在离心力场的作用下，样品中的颗粒往管底方向沉降，按其沉降系数或浮力密度的差异分离成不连续区带；等密度离心选用短粗离心管，速率区带离心选用细长离心管，它们是制备离心机作分析的通用技术。水平转子在少数情况下也用于差速离心机分离。由于水平转子的半径—体积关系比较简单，易于形成等动力梯度，所以它是用制备机测定沉降系数的主要方法。
