早期的风淋室净化系统中，风淋电机的起停多为手动控制，洁净区与自然区通道门也不能自动互锁，容易由于员工疏忽或贪图方便不遵守风淋净化规程造成生产区环境污染。

风淋室是随着微处理器、传感器等制造及应用技术的发展，目前的风淋净化控制系统，不仅有完善可靠的洁净区与自然区通道门的双门电磁自动互锁装置，通道门是否可靠闭合的光检测技术及通道门闭合异常情况下的声光，红外传感的风淋电机自动起停及风淋过程精确定时控制，还引入了紫外光细菌杀灭，人性化的语音提示，系统节能降耗等新的设计理念。

风淋室由于近邻复杂的工业生产环境，加上风淋室净化控制系统自有的门锁控制器件电磁动作、电机起停等因素的干扰，在由普通的微处理器构成的风淋净化控制系统运行可靠性不易得到有效保障的情况下，一些风淋室净化控制系统的设计采用了工业PLC控制技*，这类系统在满足主要设计功能的同时，也一定程度上限制了系统对显示、语音等技*的灵活应用。